เมื่อถึงปี พ.ศ. 2523-2524 การเดินรถสายใต้ มีการเปลี่ยนแปลง และยกเลิกขบวน ที่วิ่งจากบางกอกน้อย ไปสถานีบ้านหมอ พร้อมกับ มีการเปลี่ยนแปลง ระบบการซ่อมบำรุง รถจักรดีเซลขึ้น โดยในขณะนั้น วิศวกรกำกับการเขต 1 บางซื่อ คือ นายธวัช เกศศร ต้องการขยายปริมาณ การซ่อมบำรุงรถจักรดีเซล Alsthom ขึ้นที่โรงรถจักรธนบุรี เพื่อ รองรับปริมาณการซ่อม ที่โรงซ่อมรถจักรที่บางซื่อ และมักกะสัน จึงจัดช่างฝีมือ ที่จบจากโรงเรียนวิศวกรรมรถไฟ จำนวน 30 กว่านาย มาบุกเบิกทำการ ซ่อมวาระ รถจักร Alsthom รุ่น ALS , AHK , ALD , ADD โดยซ่อมตั้งแต่วาระ 3,000 ชม. 6,000 ชม.และ 12,000 ชม. พร้อมได้ขยายภารกิจ การซ่อมรถจักรดีเซลอีกหลายชนิด เช่น รถจักร Hitachi, Henshel , Krupp, GE เพิ่มขึ้น

     ในปี พ.ศ. 2540 ทาง วกข.บซ. สมัยนั้น ได้ให้โรงรถจักรธนบุรี รับภาระซ่อมวาระ 2 ปีรถจักร GEA และ HID อีก 2 ชนิด ซึ่งมีพนักงานช่างฝีมือ ผู้ควบคุม และพนักงานเทคนิค และพนักงานด้านงานสนับสนุน การซ่อมบำรุงรวมกัน 42 นาย ต่อมาในปี พ.ศ.2542 ทาง วซข.บซ. ได้จัดส่ง Lifting Jacks. ขนาด 100 ตัน มาให้จำนวน 4 ตัว ตัวละ 25 ตัน นำมายกตัวรถจักร Alsthom, GE เพื่อเปลี่ยนล้อ และ TM. สนับสนุน งานซ่อมบำรุงรถจักรอีกส่วน และก็เริ่มดำเนินการเปลี่ยนล้อ TM มาตั้งแต่วันที่ 16 กันยายน 2542 เป็นต้นมา